Der FC Carl Zeiss Jena, gegründet am 13. Mai 1903 als Fußballabteilung des Vereins „Centrale für Glühlampen“, hat eine bewegte und traditionsreiche Geschichte. Der Verein, der nach dem renommierten Optikunternehmen Carl Zeiss benannt wurde, spielte eine bedeutende Rolle im deutschen und internationalen Fußball.
In den frühen Jahren etablierte sich der Club schnell in der regionalen Fußballszene und schloss sich 1911 der Nordostdeutschen Fußball-Meisterschaft an. Nach dem Ersten Weltkrieg konsolidierte sich der Verein und erlebte in den 1920er und 1930er Jahren eine Phase des Wachstums und Erfolgs.
Nach dem Zweiten Weltkrieg wurde der Verein in die Betriebssportgemeinschaft (BSG) Carl Zeiss Jena integriert, was zu einem neuen Aufschwung führte. In den 1950er Jahren spielte die Mannschaft in der DDR-Oberliga, der höchsten Spielklasse der DDR. Der Verein erzielte in dieser Zeit bemerkenswerte Erfolge, darunter mehrere DDR-Meisterschaften und FDGB-Pokalsiege. 1963 wurde die BSG in den Fußballclub Carl Zeiss Jena umbenannt und konzentrierte sich fortan ausschließlich auf den Fußballsport.
Die 1960er und 1970er Jahre waren die goldene Ära des FC Carl Zeiss Jena. Der Club gewann dreimal die DDR-Meisterschaft (1963, 1968, 1970) und wurde viermal FDGB-Pokalsieger (1960, 1972, 1974, 1980). Der größte internationale Erfolg gelang 1981, als der Verein das Finale des Europapokals der Pokalsieger erreichte, wo man knapp gegen Dinamo Tbilisi verlor.
Nach der Wiedervereinigung Deutschlands im Jahr 1990 musste sich der Verein neuen Herausforderungen stellen. Der FC Carl Zeiss Jena trat zunächst in der 2. Bundesliga an, konnte jedoch nicht dauerhaft die Erfolge der DDR-Zeit wiederholen und stieg mehrfach ab und auf. Die finanzielle Situation des Vereins war oft angespannt, was zu weiteren sportlichen Rückschlägen führte.
In den 2000er Jahren durchlief der Verein eine Phase der Konsolidierung. Nach einigen Jahren in der Regionalliga und der 3. Liga gelang 2006 der Aufstieg in die 2. Bundesliga, allerdings konnte der Club die Klasse nicht halten und stieg 2008 wieder ab. Der FC Carl Zeiss Jena kämpfte weiter um Stabilität und sportlichen Erfolg, wobei er sich als Ausbildungsverein profilierte und talentierte Spieler förderte.
Heute spielt der FC Carl Zeiss Jena in der Regionalliga Nordost und arbeitet kontinuierlich daran, an die früheren Erfolge anzuknüpfen. Der Verein bleibt eine feste Größe im deutschen Fußball und genießt eine treue Fangemeinde.
Der FC Carl Zeiss Jena ist ein Symbol für Beständigkeit und Tradition im deutschen Fußball. Trotz zahlreicher Höhen und Tiefen hat der Verein seine Identität bewahrt und bleibt ein wichtiger Bestandteil der Sportkultur in Jena, in Thüringen und darüber hinaus.